Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930583I09RikQ9D2E3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930583I09RikQ9D2E3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms