Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc6bQ9D289 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc6bQ9D289 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms