Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl53Q9D1H8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl53Q9D1H8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl53Q9D1H8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms