Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed3Q9D0L1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed3Q9D0L1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms