Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc47Q9D024 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc47Q9D024 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms