Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Shmt2Q9CZN7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Shmt2Q9CZN7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms