Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajc18Q9CZJ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajc18Q9CZJ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnajc18Q9CZJ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc18Q9CZJ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc18Q9CZJ9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc18Q9CZJ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc18Q9CZJ9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc18Q9CZJ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc18Q9CZJ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnajc18Q9CZJ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnajc18Q9CZJ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms