Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nde1Q9CZA6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nde1Q9CZA6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms