Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdhd3Q9CYW4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdhd3Q9CYW4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdhd3Q9CYW4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms