Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChtopQ9CY57 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms