Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mis12Q9CY25 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mis12Q9CY25 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms