Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nip7Q9CXK8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nip7Q9CXK8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms