Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb2bQ9CWF2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb2bQ9CWF2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb2bQ9CWF2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms