Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smc3Q9CW03 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms