Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRC3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CRC3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CRC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CRC3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CRC3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CRC3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CRC3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRC3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CRC3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CRC3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CRC3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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