Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cox16Q9CR63 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cox16Q9CR63 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cox16Q9CR63 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cox16Q9CR63 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cox16Q9CR63 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms