Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vta1Q9CR26 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vta1Q9CR26 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms