Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nicn1Q9CQM0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nicn1Q9CQM0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms