Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl11Q9CQF0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl11Q9CQF0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl11Q9CQF0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 459 ms