Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chchd1Q9CQA6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chchd1Q9CQA6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms