Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
1700129C05RikQ9CQ77 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700129C05RikQ9CQ77 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms