Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ70

H2afb1, Histone H2A-Bbd type 1, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb1Q9CQ70 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2afb1Q9CQ70 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afb1Q9CQ70 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2afb1Q9CQ70 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms