Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nudcd2Q9CQ48 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nudcd2Q9CQ48 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms