Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930519G04RikQ9CPT7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930519G04RikQ9CPT7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms