Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlhe41Q99PV5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe41Q99PV5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms