Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU5

Acsbg1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsbg1Q99PU5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Acsbg1Q99PU5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Acsbg1Q99PU5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Acsbg1Q99PU5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms