Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP6

Trim34a, Tripartite motif-containing protein 34A, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34aQ99PP6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim34aQ99PP6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim34aQ99PP6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim34aQ99PP6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms