Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Trim26Q99PN3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim26Q99PN3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim26Q99PN3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms