Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2a1Q99PM3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2a1Q99PM3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2a1Q99PM3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 537.3 ms