Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nup155Q99P88 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup155Q99P88 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nup155Q99P88 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms