Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab27bQ99P58 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab27bQ99P58 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms