Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vgll1Q99NC0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms