Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b1Q99NB9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b1Q99NB9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b1Q99NB9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b1Q99NB9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sf3b1Q99NB9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sf3b1Q99NB9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sf3b1Q99NB9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sf3b1Q99NB9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms