Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a6dQ99N07 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6dQ99N07 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6dQ99N07 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms