Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprtQ99M80 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprtQ99M80 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
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