Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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