Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp5lQ99LH9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bp5lQ99LH9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp5lQ99LH9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms