Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo2Q99LG2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo2Q99LG2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo2Q99LG2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms