Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpifQ99KR7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpifQ99KR7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms