Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf19Q99KP6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prpf19Q99KP6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms