Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hps4Q99KG7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hps4Q99KG7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms