Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dok4Q99KE3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms