Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd6Q99JI4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Psmd6Q99JI4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd6Q99JI4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms