Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn3Q99JH7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clstn3Q99JH7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms