Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smim11aQ99J19 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Smim11aQ99J19 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Smim11aQ99J19 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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