Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PdgfdQ925I7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PdgfdQ925I7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms