Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tom1l1Q923U0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1l1Q923U0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1l1Q923U0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms