Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Csmd1Q923L3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csmd1Q923L3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms