Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Clip1Q922J3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
Clip1Q922J3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Clip1Q922J3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms