Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sf3b3Q921M3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b3Q921M3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms